Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms