Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARD11Q9BXL7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARD11Q9BXL7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms