Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HIRIP3Q9BW71 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HIRIP3Q9BW71 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms