Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KATNB1Q9BVA0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms