Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKNK1Q9BUB5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms