Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms