Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms