Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms