Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms