Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms