Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYD88Q99836 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms