Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms