Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED4Q96RK1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms