Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms