Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD6Q96NK8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms