Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms