Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf85Q96MD7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms