Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf42Q96LP6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf42Q96LP6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms