Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHACTR3Q96KR7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR3Q96KR7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms