Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms