Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VCPIP1Q96JH7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms