Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
VPS50Q96JG6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms