Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms