Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms