Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms