Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms