Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRN2Q92932 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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