Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIFAP3Q92845 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms