Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN4Q92575 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms