Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY2Q8WXA3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms