Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWA1

TMEM40, Transmembrane protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM40Q8WWA1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM40Q8WWA1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms