Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCAF4Q8WV16 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF4Q8WV16 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms