Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP133Q8WUM0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP133Q8WUM0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms