Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms