Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC148Q8NFR7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms