Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP35Q8NFH5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms