Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA4Q8NEY3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms