Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC21AQ8NDW8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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