Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBOF1Q8ND07 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms