Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RDH13Q8NBN7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH13Q8NBN7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms