Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNBD1Q8NA66 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms