Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJD3Q8N144 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms