Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB8

SUPV3L1, ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPV3L1Q8IYB8 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CLASP2-208ENST00000467956 485 ntTSL 213.6□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-213ENST00000549450 581 ntTSL 513.54□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC4-205ENST00000454542 565 ntTSL 413.46□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-13■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AMDHD2-206ENST00000563444 529 ntTSL 213.34□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CSNK2B-205ENST00000465481 579 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ENO2-212ENST00000542509 825 ntTSL 513.3□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 USP5-206ENST00000542087 438 ntTSL 313.22□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 513.2□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AGPAT5-203ENST00000523234 2525 ntTSL 513.13□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MRPL3-205ENST00000507669 848 ntTSL 313.07□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ARID1B-201ENST00000319584 2199 ntTSL 213.06□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PHGDH-201ENST00000369407 3180 ntTSL 213.04□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 213.03□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LARS2-208ENST00000485461 580 ntTSL 412.99□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-211ENST00000520329 836 ntTSL 512.98□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-206ENST00000518254 755 ntTSL 512.98□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LTBP3-218ENST00000530866 3756 ntTSL 212.95□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.345e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FAM133B-208ENST00000481407 2293 ntTSL 212.88□□□□□ -0.355e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PFKFB4-211ENST00000471890 553 ntTSL 412.88□□□□□ -0.357e-14■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRC1-218ENST00000560605 576 ntTSL 412.82□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ABHD5-204ENST00000456453 876 ntTSL 412.78□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TXNRD2-221ENST00000635155 858 ntTSL 512.74□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-223ENST00000524169 784 ntTSL 312.71□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPG7-222ENST00000569820 2305 ntTSL 512.68□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NIPSNAP2-204ENST00000446692 662 ntTSL 412.63□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZMIZ1-203ENST00000472035 457 ntTSL 212.59□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.45e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.45e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LINC00969-214ENST00000446521 584 ntTSL 412.39□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BANP-219ENST00000485772 608 ntTSL 512.38□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 212.37□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-214ENST00000549821 596 ntTSL 312.35□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRC1-208ENST00000555791 660 ntTSL 412.31□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AFF4-203ENST00000378595 3348 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-218ENST00000551724 552 ntTSL 412.29□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 INVS-202ENST00000262457 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NR2F2-AS1-213ENST00000616912 518 ntTSL 512.21□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ENTPD6-214ENST00000463734 639 ntTSL 212.21□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PHYKPL-208ENST00000481811 2709 ntTSL 212.12□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PSTPIP2-202ENST00000587042 859 ntTSL 212.12□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC2-217ENST00000524334 570 ntTSL 412.11□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RFX5-203ENST00000392746 2056 ntTSL 512.09□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-209ENST00000430331 432 ntTSL 512.09□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MARCH6-208ENST00000510792 1963 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF621-203ENST00000403205 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-219ENST00000552161 585 ntTSL 211.96□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.55e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CABIN1-213ENST00000496016 557 ntTSL 211.94□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC2-211ENST00000521233 733 ntTSL 211.91□□□□□ -0.55e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SETD2-203ENST00000412450 4231 ntTSL 211.9□□□□□ -0.515e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 411.86□□□□□ -0.517e-14■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PSTPIP2-201ENST00000409746 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.525e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-206ENST00000547238 1154 ntTSL 211.75□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.535e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CEP83-207ENST00000547232 2166 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.535e-6■■■■■ 81.8
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