Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms