Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms