Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY3Q7L099 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUFY3Q7L099 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms