Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC80Q76M96 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms