Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM47EQ6ZV65 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM47EQ6ZV65 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms