Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM43BQ6ZT52 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms