Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms